La Conselleria de Innovación, Universidades, Ciencia y Sociedad Digital es el departamento del Consell al que corresponde ejercer las competencias en materia de universidades, ciencia, investigación e innovación tecnológica.
La Dirección General de Ciencia e Investigación ejerce las competencias en materia de política científica y de investigación; planificación estratégica para el desarrollo de la investigación científica; promoción y financiación de la investigación;, apoyo al talento investigador y a los parques científicos; implantación y mejora de infraestructuras y equipamiento para la investigación.